阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台

  • 发布时间:2020-05-01 09:17:53
  • 关键词:

    300

  • 浏览量:340
  • 简单描述:

    北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台

文章内容

北京生命科学研究院成功构建大资料统计整合挖掘和分析平台

  【 头像新闻网仪表研发】 月 日,国内科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在全世界期刊GenomeBiology发表题为CircAtlas:anintegratedresourceofonemillionhighlyaccuratecircularRNAsfrom 零 零vertebratetranscriptomes 研究论文。该研究基于现有 海量转录组资料统计,采用多维资料统计智能整合分析手段,成功解析了跨物种、多组织、大样本 环形转录本表明特征和进化规律,为探索真核生物复杂多变 环形RNA全貌和产生机制提供了强有力 资料统计支持。

  在上述资料统计 基础上,他们进 步提出了新 保守环形RNA识别技术和保守性多层次评估机制。通过结合全局比对和反向剪接位点 局部比对特征,筛选出超过 万保守 环形RNA,并进 步结合物种间、组织间和个体间 表明 致性对其保守性进行打分(MultipleConservationScore),直观反映出环形转录本在不同层次 保守性和进化规律,对功能环形RNA分子 筛选具有重要意义。此外,研究人员还结合保守性和表明量信息, 头像新闻网详实报道,对收录 环形RNA进行重新命名,并提供多个环形RNA资料统计库间 名称查询和转换功能,厘清了环形RNA领域存在 命名混乱问题。此外,利用重建 环形RNA全长序列,该团队首次通过大规模分析其可能 ORF和IRES序列,去预测其翻译成蛋白质 潜力。进 步结合CLIP等多组学资料统计,构建环形RNA和mRN miRNA及RBP 表明调控网络,并结合网络中众多调控元件 注释信息对环形RNA 功能进行预测。该研究为环形RNA 功能挖掘和注释提供了重要 分析工具。

  研究人员通过整合自有及公共转录组资料统计,获得覆盖 个物种(人、猴、小鼠、大鼠、猪和鸡) 个组织类型,共计 零 零个转录组资料统计集, 头像新闻网据了解,构建了目前覆盖物种广、资料统计齐全 环形RNA整合资料统计资源平台circAltas(http://circatlas.biols.ac.cn)。该平台收录超过 零零万个高质量 环形RNA分子,其中> 零%具有全长转录本序列。此外, 头像新闻网商业讯息平台,通过整合功能组学资料统计和注释信息,为环形RNA资料统计挖掘和功能研究提供了重要 资料统计资源和技术保障。

  该工作由赵方庆课题组 博士研究生吴婉莹和助理研究员冀培丰完成,并获得了国家自然科学基金委、科技部重点研发计划及中科院 经费支持。赵方庆团队在前期 工作中建立了环形RNA识别和质控、转录本组装、可变剪接识别及定量等 系列技术和工具,相关研究发表在GenomeBiology(之前, 零 零)、NatureCommunications( 零 , 零 零)、BriefingsinBioinformatics( 零 )、TrendsinGenetics( 零 )、GenomeMedicine( 零 )、CellReports( 零 )和Bioinformatics( 零 零)。这些研究丰富了人们对环形RNA 表明和功能 认识,为深入了解这 崭新类型 非编码RNA分子奠定了技术学基础。

  近年来,环形RNA作为 类新型 内源性非编码RNA在生物系统调控和疾病发展过程中 作用不断被发现和扩展。高通量测序技术 快速发展和广泛应用,更是将环形RNA研究带入了大资料统计时代,使之迅速成为RNA研究领域 热点之 。环形RNA转录组资料统计 大量积累,给研究人员带来了新 机遇和挑战,如何是从转录组资料统计海洋中高效筛选和获取具有重要生物学功能 环形RNA分子。物种信息 日益丰富为全面解读复杂 环形RNA转录调控过程打开新 突破口,基于多物种 进化保守性分析将有助于筛选出具有潜在功能 环形转录本,而多组学资料统计 整合分析则可以从不同层次解析环形RNA 表明调控过程。

,
阿荣旗其它产品信息
  • 阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台

    阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台

  • 武冈方面获悉计量所召开企业质量《直流电能表检定装置技术规范》修订编制启动

    武冈方面获悉计量所召开企业质量《直流电能表检定装置技术规范》修订编制启动

  • 河东区据媒体报道VOCs监测治理攻坚行动开始 近百亿市场前景可期

    河东区据媒体报道VOCs监测治理攻坚行动开始 近百亿市场前景可期

  • 开县据新闻报道今年空气压缩机行业市场现状及竞赛格局分析

    开县据新闻报道今年空气压缩机行业市场现状及竞赛格局分析

  • 南岳区当地报道合肥研究院研制新型气溶胶光学吸湿增长特性测量装置

    南岳区当地报道合肥研究院研制新型气溶胶光学吸湿增长特性测量装置

  • 城阳区根据网络获悉爱肤慎用化妆品 检测仪器护安全

    城阳区根据网络获悉爱肤慎用化妆品 检测仪器护安全

  • 平舆进行报道东南大学成功制备新型X射线探测器半导体材料

    平舆进行报道东南大学成功制备新型X射线探测器半导体材料

  • 六枝特区公司获悉《总磷快速测定仪》等九项团体质量立项评审会召开

    六枝特区公司获悉《总磷快速测定仪》等九项团体质量立项评审会召开

  • 提示:提示:阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台信息,为您提供阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台由我们公司,阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台服务等信息。如果您购买阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台产品,请确定后,打公司账户,并且签订阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台协议。以上阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台属于商业贸易行为。以上所展示的信息由卖家自行提供,内容的真实性、准确性和合法性由发布卖家负责,请意识到互联网交易中的风险是客观存在的。希望大家诚信合作,合作共赢,一起维护一个和谐守法纯净的网络环境,如果您在阿荣旗显示北京生命科学研究院成功构建大数据整合挖掘和分析平台中发现任何不实信息,或者该信息侵犯了您的合法权益,我们将积极配合认真处理,及时删除信息,特此声明!